| 武器名 | 概要 | 武器庫登録 | 装弾数 | 携行弾数 | 備考 |
| Centurion | E99製の弾丸を使用する単発式リボルバー | 可能 | 6(-) | 24+装弾数 | |
| AR9 Valkyrie | USSRの主力アサルトライフル | 可能 | 30(-) | 360+装弾数 | |
| Volk S4 | セミオートショットガン | 可能 | 6(-) | 72+装弾数 | |
| Kashimov SNV-E99 | 改良型のセミオート・スナイパーライフル | 可能 | 5(-) | 24+装弾数 | エイム中R3を押すことで時間の流れを遅く出来る |
| AutoCannon | ガトリングガン | 可能 | 100/150/200 | 600+装弾数 | |
| Spikeshot | E99エネルギーをチャージした爆弾スパイクを発射できるレールガン | 可能 | 5(-) | 20+装弾数 | 完全にチャージするまでに待機時間が必要 |
| Dethex Launcher | グレネードランチャー | 可能 | R1で発射後L1を押したままの時Lスティックで弾の移動が可能。再度R1で起爆 | ||
| Seeker | E99チャージ弾を発射することが出来るライフル | 不可能 | 6 | 12+6 | エイム状態で発射後、L1押しっぱなしで銃弾の弾道コントロールが可能 |
| RLS-7 | ロケットランチャー | 不可能 | 発射後対象をロックし続ける事で弾の誘導が可能 |
| インパルス | TDMエネルギーを消費し衝撃波を飛ばす「インパルス」攻撃をします。 | 初期から使用可能 |
| リニュー/エイジング | 時間を進めたり、戻すことが出来ます。 また時間を進め老化させる事によって敵を倒す他、素早く2回使用する事で敵をモンスターにする事ができます(変異) |
初期から使用可能 モンスター化(変異)は物語途中で強化③ |
| クロノソナー | 使用することで主人公が進むべき方向を青く光る足跡で示します。 | 初期から使用可能 |
| 重力制御 | 一部の物を引き寄せることが出来ます。また、その状態で射撃ボタンを押すことで前方に飛ばせる場合もあります。 | 物語途中で強化① |
| デッドロック | デッドロックと言われる塊を作り出し、範囲内の時間の流れを遅らせる事ができます。 | 物語途中で強化② |
